在緩沖液中加入離子型表面活性劑如十二烷基硫酸鈉，形成膠束，被分離物質在水相和膠束相(準固定相)之間發生分配并隨電滲流在毛細管內遷移，達到分離，Biorad電泳槽能用于中性物質的分離。
　　在高壓電場作用下，形成雙電層一側的緩沖液由于帶正電而向負極方向移動，從而形成電滲流。同時，在緩沖溶液中，帶電粒子在電場作用下，以各自不同速度向其所帶電荷極性相反方向移動，形成電泳。帶電粒子在毛細管緩沖液中的遷移速度等于電泳和電滲流的矢量和。各種粒子由于所帶電荷多少、質量、體積以及形狀不同等因素引起遷移速度不同而實現分離。
　　電泳儀電源開關調至關的位置，電壓旋鈕轉到小，根據工作需要選擇穩壓穩流方式及電壓電流范圍。用Biorad電泳槽的兩個電極與電泳儀的直流輸出端聯接，注意極性不要接反。接通電源，緩緩旋轉電壓調節鈕直到達到的所需電壓為止，設定電泳終止時間，此時電泳即開始進行。工作完畢后，應將各旋鈕、開關旋至零位或關閉狀態，并撥出電泳插頭。
　　儀器通電后，不要臨時增加或撥除輸出導線插頭，以防短路現象發生，雖然儀器內部附設有保險絲，但短路現象仍有可能導致儀器損壞。
　　在總電流不超過儀器額定電流時，可以多槽關聯使用，但要注意不能超載，否則容易影響儀器壽命。由于不同介質支持物的電阻值不同，電泳時所通過的電流量也不同，其泳動速度及泳至終點所需時間也不同，故不同介質支持物的電泳不要同時在同一電泳儀上進行。某些特殊情況下需檢查儀器電泳輸入情況時，允許在穩壓狀態下空載開機，但在穩流狀態下必須先接好負載再開機，否則電壓表指針將大幅度跳動，容易造成不必要的人為機器損壞。使用過程中發現異常現象，如較大噪音、放電或異常氣味，須立即切斷電源，進行檢修，以免發生意外事故。